Outils IA modifient l’ADN humain avec succès.

Dans le domaine médical, l’IA aide à détecter des problèmes tels que les rythmes cardiaques irréguliers et à identifier le cancer de la peau. Cependant, l’implication de l’IA dans notre génome est-elle nécessaire ? Profluent, une entreprise de conception de protéines fondée en 2022 à Berkeley, en Californie, le pense.

Profluent a enquêté sur des méthodes pilotées par l’IA pour étudier et créer des protéines nouvelles qui ne se trouvent pas naturellement. Cette semaine, l’entreprise a célébré une avancée significative avec l’introduction d’une protéine développée par l’IA appelée OpenCRISPR-1.

Aider à la Modification de l’ADN dans le Système d’Édition de Gènes CRISPR

La protéine fonctionne dans le système d’édition de gènes CRISPR, découpant un segment d’ADN pour faciliter la réparation ou le remplacement de gènes. Les chercheurs ont activement utilisé CRISPR depuis environ 15 ans, ce qui a conduit ses créateurs à recevoir le prix Nobel de chimie en 2020.

Il a démontré son potentiel en tant qu’outil biomédical capable de restaurer la vision et de traiter des maladies rares, ainsi qu’en tant qu’outil agricole capable d’améliorer les niveaux de vitamine D dans les tomates et de raccourcir les temps de floraison des arbres de décennies à mois, entre autres applications.

Traditionnellement, CRISPR a utilisé des protéines naturellement présentes pour effectuer ses tâches de découpe d’ADN.

Plus précisément, il utilise la protéine Cas9, initialement provenant de bactéries, pour ouvrir les brins d’ADN en vue de modifier les séquences géniques.

L’équipe de Profluent a utilisé l’IA pour développer une base de données de 5,1 millions de protéines similaires à Cas9, dépassant les bases de données précédentes de 2,7 fois au total et de 4,1 fois pour les protéines Cas9. Un modèle d’IA a ensuite été formé sur cette base de données pour identifier les protéines potentielles pour les applications CRISPR.

OpenCRISPR-1 Surpasse avec des Effets Hors-Cible Réduits

Guidé par Profluent, le système a réduit les résultats de 4 millions de séquences, ce qui a abouti à la sélection d’OpenCRISPR-1. Lors des tests, cette nouvelle protéine a performé de manière similaire à Cas9 mais a réduit les effets hors-cible de 95 %, démontrant une précision accrue et une réduction des dommages non intentionnels à l’ADN.

Dans un geste rare, Profluent a rendu sa protéine disponible à la communauté scientifique, d’où la désignation “open” d’OpenCRISPR-1.

Peter Cameron, vice-président et responsable de l’édition de gènes chez Profluent, a commenté : “L’annonce d’aujourd’hui marque un moment décisif et le début de ce que nous anticipons comme un processus continu alors que nous avançons vers la prochaine ère de la médecine génétique. Nous invitons la communauté de l’édition de gènes à tester rigoureusement OpenCRISPR-1. Si certains aspects pourraient être améliorés pour des applications spécifiques, nous accueillons les retours et sommes ouverts à la collaboration pour optimiser ces caractéristiques.”

Raison de préoccupation ?

À première vue, l’utilisation de l’IA pour modifier l’ADN peut susciter des préoccupations. Cependant, les craintes telles que celles des “enfants insectes” ou les comparaisons au “Dr Frankenstein”, comme mentionné dans le post X du PDG Ali Madani, sont largement exagérées. Profluent a tiré parti de la capacité de l’IA à traiter rapidement de vastes quantités de données et à parvenir à des conclusions de manière plus efficace que ce qui est humainement possible.

Plutôt que des expériences génétiques douteuses, l’entreprise estime que cette nouvelle technologie permettra des traitements génétiques rapides et précis pour des maladies prévalentes.

“Nous publions publiquement OpenCRISPR-1, un éditeur de gènes conçu par IA performant, pour encourager une utilisation généralisée et éthique dans les secteurs de la recherche et commercial”, ont déclaré les membres de l’équipe de Profluent dans un article de blog. “Notre objectif est de favoriser l’innovation et le progrès au sein de la communauté de l’édition de gènes, en offrant finalement de nouveaux traitements aux patients confrontés à des besoins médicaux significatifs non satisfaits.”

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Lisez l’article original sur : New Atlas

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